En el caso de los hongos de interior, hay que evitar y reparar goteras, filtraciones, fugas de las conducciones de agua. Se debe ventilar y, cuando sea posible, permitir que entre luz solar en todas las habitaciones de la casa.
En el caso de los hongos de exterior es más difícil evitarlos; en todo caso se debe evitar ir a lugares humedos, no se deben remover hojas y ramas, y se deben evitar zonas húmedas y encharcadas. Dada la dificultad de evitar los hongos, es frecuentemente necesario recurrir al uso de inmunoterapia, las llamadas vacunas de la alergia.